This function extracts timed edgelists for objects of class
netdx into a data frame using the generic
as.data.frame function.
Usage
# S3 method for class 'netdx'
as.data.frame(x, row.names = NULL, optional = FALSE, sim = NULL, ...)Arguments
Examples
# \donttest{
# Initialize and parameterize the network model
nw <- network_initialize(n = 100)
formation <- ~edges
target.stats <- 50
coef.diss <- dissolution_coefs(dissolution = ~offset(edges), duration = 20)
# Model estimation
est <- netest(nw, formation, target.stats, coef.diss, verbose = FALSE)
#> Starting simulated annealing (SAN)
#> Iteration 1 of at most 4
#> Finished simulated annealing
#> Starting maximum pseudolikelihood estimation (MPLE):
#> Obtaining the responsible dyads.
#> Evaluating the predictor and response matrix.
#> Maximizing the pseudolikelihood.
#> Finished MPLE.
# Simulate the network with netdx
dx <- netdx(est, nsims = 3, nsteps = 10, keep.tedgelist = TRUE,
verbose = FALSE)
# Extract data from the first simulation
as.data.frame(dx, sim = 1)
#> onset terminus tail head onset.censored terminus.censored duration edge.id
#> 1 0 11 2 34 FALSE TRUE 11 1
#> 2 0 7 3 23 FALSE FALSE 7 2
#> 3 0 11 5 18 FALSE TRUE 11 3
#> 4 0 8 5 52 FALSE FALSE 8 4
#> 5 0 11 5 67 FALSE TRUE 11 5
#> 6 0 11 6 47 FALSE TRUE 11 6
#> 7 0 5 6 64 FALSE FALSE 5 7
#> 8 0 11 6 67 FALSE TRUE 11 8
#> 9 0 11 7 62 FALSE TRUE 11 9
#> 10 0 11 7 96 FALSE TRUE 11 10
#> 11 0 5 8 64 FALSE FALSE 5 11
#> 12 0 4 10 38 FALSE FALSE 4 12
#> 13 0 11 12 58 FALSE TRUE 11 13
#> 14 0 10 13 58 FALSE FALSE 10 14
#> 15 0 9 15 36 FALSE FALSE 9 15
#> 16 0 11 16 39 FALSE TRUE 11 16
#> 17 0 1 16 68 FALSE FALSE 1 17
#> 18 0 3 16 97 FALSE FALSE 3 18
#> 19 0 11 17 83 FALSE TRUE 11 19
#> 20 0 11 18 27 FALSE TRUE 11 20
#> 21 0 7 19 69 FALSE FALSE 7 21
#> 22 0 11 19 92 FALSE TRUE 11 22
#> 23 0 11 20 59 FALSE TRUE 11 23
#> 24 0 4 21 67 FALSE FALSE 4 24
#> 25 0 1 23 58 FALSE FALSE 1 25
#> 26 0 11 26 65 FALSE TRUE 11 26
#> 27 0 11 27 34 FALSE TRUE 11 27
#> 28 0 11 27 72 FALSE TRUE 11 28
#> 29 0 11 28 70 FALSE TRUE 11 29
#> 30 0 11 30 36 FALSE TRUE 11 30
#> 31 0 11 30 41 FALSE TRUE 11 31
#> 32 0 11 31 33 FALSE TRUE 11 32
#> 33 0 11 31 51 FALSE TRUE 11 33
#> 34 0 8 33 81 FALSE FALSE 8 34
#> 35 0 11 34 38 FALSE TRUE 11 35
#> 36 0 10 35 67 FALSE FALSE 10 36
#> 37 0 11 36 55 FALSE TRUE 11 37
#> 38 0 11 38 96 FALSE TRUE 11 38
#> 39 0 11 41 91 FALSE TRUE 11 39
#> 40 0 7 42 80 FALSE FALSE 7 40
#> 41 0 7 45 79 FALSE FALSE 7 41
#> 42 0 1 46 97 FALSE FALSE 1 42
#> 43 0 8 51 74 FALSE FALSE 8 43
#> 44 0 11 62 67 FALSE TRUE 11 44
#> 45 0 4 63 66 FALSE FALSE 4 45
#> 46 0 11 64 94 FALSE TRUE 11 46
#> 47 0 2 65 75 FALSE FALSE 2 47
#> 48 0 11 65 89 FALSE TRUE 11 48
#> 49 0 11 67 79 FALSE TRUE 11 49
#> 50 0 11 68 81 FALSE TRUE 11 50
#> 51 0 3 70 100 FALSE FALSE 3 51
#> 52 0 11 72 81 FALSE TRUE 11 52
#> 53 0 10 75 99 FALSE FALSE 10 53
#> 54 0 11 78 96 FALSE TRUE 11 54
#> 55 0 10 81 84 FALSE FALSE 10 55
#> 56 0 11 89 98 FALSE TRUE 11 56
#> 57 1 6 26 55 FALSE FALSE 5 57
#> 58 1 11 25 47 FALSE TRUE 10 58
#> 59 1 5 60 92 FALSE FALSE 4 59
#> 60 1 2 5 82 FALSE FALSE 1 60
#> 61 2 8 46 63 FALSE FALSE 6 61
#> 62 2 11 19 70 FALSE TRUE 9 62
#> 63 2 11 66 89 FALSE TRUE 9 63
#> 64 2 9 50 84 FALSE FALSE 7 64
#> 65 3 11 16 34 FALSE TRUE 8 65
#> 66 3 11 38 65 FALSE TRUE 8 66
#> 67 3 11 54 91 FALSE TRUE 8 67
#> 68 3 7 53 74 FALSE FALSE 4 68
#> 69 3 11 69 89 FALSE TRUE 8 69
#> 70 4 11 38 77 FALSE TRUE 7 70
#> 71 4 7 24 32 FALSE FALSE 3 71
#> 72 4 11 45 92 FALSE TRUE 7 72
#> 73 5 11 82 98 FALSE TRUE 6 73
#> 74 6 11 44 64 FALSE TRUE 5 74
#> 75 7 11 40 92 FALSE TRUE 4 75
#> 76 7 11 26 33 FALSE TRUE 4 76
#> 77 7 11 7 65 FALSE TRUE 4 77
#> 78 8 11 43 50 FALSE TRUE 3 78
#> 79 8 11 73 92 FALSE TRUE 3 79
#> 80 9 11 44 48 FALSE TRUE 2 80
#> 81 9 11 76 91 FALSE TRUE 2 81
#> 82 9 11 52 83 FALSE TRUE 2 82
#> 83 9 11 45 50 FALSE TRUE 2 83
#> 84 9 11 30 76 FALSE TRUE 2 84
#> 85 10 11 13 66 FALSE TRUE 1 85
# Extract data from all simulations
as.data.frame(dx)
#> sim onset terminus tail head onset.censored terminus.censored duration
#> 1 1 0 11 2 34 FALSE TRUE 11
#> 2 1 0 7 3 23 FALSE FALSE 7
#> 3 1 0 11 5 18 FALSE TRUE 11
#> 4 1 0 8 5 52 FALSE FALSE 8
#> 5 1 0 11 5 67 FALSE TRUE 11
#> 6 1 0 11 6 47 FALSE TRUE 11
#> 7 1 0 5 6 64 FALSE FALSE 5
#> 8 1 0 11 6 67 FALSE TRUE 11
#> 9 1 0 11 7 62 FALSE TRUE 11
#> 10 1 0 11 7 96 FALSE TRUE 11
#> 11 1 0 5 8 64 FALSE FALSE 5
#> 12 1 0 4 10 38 FALSE FALSE 4
#> 13 1 0 11 12 58 FALSE TRUE 11
#> 14 1 0 10 13 58 FALSE FALSE 10
#> 15 1 0 9 15 36 FALSE FALSE 9
#> 16 1 0 11 16 39 FALSE TRUE 11
#> 17 1 0 1 16 68 FALSE FALSE 1
#> 18 1 0 3 16 97 FALSE FALSE 3
#> 19 1 0 11 17 83 FALSE TRUE 11
#> 20 1 0 11 18 27 FALSE TRUE 11
#> 21 1 0 7 19 69 FALSE FALSE 7
#> 22 1 0 11 19 92 FALSE TRUE 11
#> 23 1 0 11 20 59 FALSE TRUE 11
#> 24 1 0 4 21 67 FALSE FALSE 4
#> 25 1 0 1 23 58 FALSE FALSE 1
#> 26 1 0 11 26 65 FALSE TRUE 11
#> 27 1 0 11 27 34 FALSE TRUE 11
#> 28 1 0 11 27 72 FALSE TRUE 11
#> 29 1 0 11 28 70 FALSE TRUE 11
#> 30 1 0 11 30 36 FALSE TRUE 11
#> 31 1 0 11 30 41 FALSE TRUE 11
#> 32 1 0 11 31 33 FALSE TRUE 11
#> 33 1 0 11 31 51 FALSE TRUE 11
#> 34 1 0 8 33 81 FALSE FALSE 8
#> 35 1 0 11 34 38 FALSE TRUE 11
#> 36 1 0 10 35 67 FALSE FALSE 10
#> 37 1 0 11 36 55 FALSE TRUE 11
#> 38 1 0 11 38 96 FALSE TRUE 11
#> 39 1 0 11 41 91 FALSE TRUE 11
#> 40 1 0 7 42 80 FALSE FALSE 7
#> 41 1 0 7 45 79 FALSE FALSE 7
#> 42 1 0 1 46 97 FALSE FALSE 1
#> 43 1 0 8 51 74 FALSE FALSE 8
#> 44 1 0 11 62 67 FALSE TRUE 11
#> 45 1 0 4 63 66 FALSE FALSE 4
#> 46 1 0 11 64 94 FALSE TRUE 11
#> 47 1 0 2 65 75 FALSE FALSE 2
#> 48 1 0 11 65 89 FALSE TRUE 11
#> 49 1 0 11 67 79 FALSE TRUE 11
#> 50 1 0 11 68 81 FALSE TRUE 11
#> 51 1 0 3 70 100 FALSE FALSE 3
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#> 54 1 0 11 78 96 FALSE TRUE 11
#> 55 1 0 10 81 84 FALSE FALSE 10
#> 56 1 0 11 89 98 FALSE TRUE 11
#> 57 1 1 6 26 55 FALSE FALSE 5
#> 58 1 1 11 25 47 FALSE TRUE 10
#> 59 1 1 5 60 92 FALSE FALSE 4
#> 60 1 1 2 5 82 FALSE FALSE 1
#> 61 1 2 8 46 63 FALSE FALSE 6
#> 62 1 2 11 19 70 FALSE TRUE 9
#> 63 1 2 11 66 89 FALSE TRUE 9
#> 64 1 2 9 50 84 FALSE FALSE 7
#> 65 1 3 11 16 34 FALSE TRUE 8
#> 66 1 3 11 38 65 FALSE TRUE 8
#> 67 1 3 11 54 91 FALSE TRUE 8
#> 68 1 3 7 53 74 FALSE FALSE 4
#> 69 1 3 11 69 89 FALSE TRUE 8
#> 70 1 4 11 38 77 FALSE TRUE 7
#> 71 1 4 7 24 32 FALSE FALSE 3
#> 72 1 4 11 45 92 FALSE TRUE 7
#> 73 1 5 11 82 98 FALSE TRUE 6
#> 74 1 6 11 44 64 FALSE TRUE 5
#> 75 1 7 11 40 92 FALSE TRUE 4
#> 76 1 7 11 26 33 FALSE TRUE 4
#> 77 1 7 11 7 65 FALSE TRUE 4
#> 78 1 8 11 43 50 FALSE TRUE 3
#> 79 1 8 11 73 92 FALSE TRUE 3
#> 80 1 9 11 44 48 FALSE TRUE 2
#> 81 1 9 11 76 91 FALSE TRUE 2
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#> 85 1 10 11 13 66 FALSE TRUE 1
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#> 105 2 0 11 32 71 FALSE TRUE 11
#> 106 2 0 1 33 55 FALSE FALSE 1
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#> edge.id
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#> 9 9
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#> 17 17
#> 18 18
#> 19 19
#> 20 20
#> 21 21
#> 22 22
#> 23 23
#> 24 24
#> 25 25
#> 26 26
#> 27 27
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